Maria João iniciou os seus estudos musicais na Artave, concluindo a Licenciatura e o Mestrado em Violino (Ensino) na ESML, onde estudou com Aníbal Lima e Bin Chao, e música de câmara com Paul Wakabayashi e Irene Lima. Aprofundou a sua formação na Codarts, em Roterdão, com Olga Martinova, e frequentou masterclasses com destacados violinistas nacionais e internacionais.
Em 2008, foi convidada pela Academia Latino-Americana «El Sistema», na Venezuela, para participar numa masterclass em Mérida, onde se apresentou a solo com a pianista Kyoungim Kim. Mais tarde, integrou a Camerata Vianna da Motta, atuando como solista no Teatro Nacional de São Carlos.
Colaborou com diversas orquestras e ensembles, nomeadamente a Orquestra do Teatro Nacional de São Carlos, a Orquestra Gulbenkian, a Orquestra de Câmara Portuguesa e o ensemble La Nave, entre outros. Apresentou-se também com artistas como Rodrigo Leão, Mariza, Sérgio Godinho e Michael Bublé, entre muitos outros.
Lecionou na École d’Art Musical, em Paris. Atualmente, é violinista e docente na OCCO/Conservatório de Música de Cascais e no projeto Orquestra Geração. É presidente da Associação Achillea e violinista do Quarteto Achillea.